2025-05-19 02:09:24
RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發現microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發生m6A修飾。m6A修飾主要發生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉移酶,目前已知這個復合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉甲基化;m6A由m6A結合蛋白識別,目前發現m6A結合蛋白(讀碼器)有YTH結構域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統METTL3是早先被鑒定為結合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內亞細胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉移酶復合體的新亞基。科研技術服務不僅提升了科研項目的成功率,也促進了科研人才的培養與發展。上海裸鼠科研技術服務培養
用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細胞水平的結合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質粒、GAG質粒、VSV質粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構建1)根據目的基因mRNA編碼區設計引物,分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區序列,連接至pMD19-T載體后轉化至感受態DH5α,分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉化到感受態DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后,將質粒轉化至感受態DH5α中,并進行無內質粒抽提。GAG質粒和VSV質粒同樣可以轉化至感受態DH5α中,并進行無內質粒抽提。質粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養基培養6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。上海裸鼠科研技術服務培養干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳,選擇紫外還是藍光?
制作該模型的方法為大鼠腹腔麻醉消毒后選取腹部正中切口打開腹腔長約2cm,尋找盲腸,小心分離其遠端與大腸的系膜,在盲腸遠端1/2處用無菌4號絲線緊緊結扎,并用無菌7號針頭在已結扎盲腸遠端處貫通穿刺,然后把盲腸推回腹腔,關閉腹腔。影響因素多數研究一致認為盲腸結扎位置是CLP模型中死亡率和疾病嚴重程度的主要決定因素。結論為:①結扎25%或以下的盲腸死亡率幾乎為零,為輕度膿毒癥;②結扎50%~60%的盲腸導致術后死亡率為60%,為中度膿毒癥;③結扎75%或以上的盲腸導致小鼠在術后2~3d內全部死亡,為重度膿毒癥。而在不同程度膿毒癥中,死亡主要集中在初的48h內。有研究通過改變盲腸結扎位置和穿刺針直徑來調節膿毒癥的嚴重程度,其中提到與結扎長度小于1cm的小鼠相比,結扎長度超過1cm的小鼠死亡率增加至**;增加穿刺針的直徑也使得存活率從**(22G針)降低至55%(19G針)。結論為:在上述兩個因素中,盲腸結扎位置比針頭大小影響更為。CLP誘導的膿毒癥術后6h即可出現菌血癥,術后約12h出現膿毒癥相關臨床癥狀,包括發熱、寒戰、毛發豎立、全身無力和活動減少等,術后18h開始死亡。總之,在制作CLP模型時。
首先,預實驗必須要當做正式實驗來對待(態度要放端正,這是必須的)。
預實驗的每一步都需要詳細規劃,多方籌謀。不論是實驗動物的選擇,還是檢測試劑的購買,都盡量和正式實驗統一標準。
建議大家先把所有試劑和藥物購買完畢后,再去購買實驗動物。
因為動物會長胖,長胖后給藥劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實驗效果。
筆者曾經提前將實驗動物買回,但因為特殊原因沒能購買到造模藥物,**終只能忍痛割愛將動物贈送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長得太胖,沒辦法用作造模)。
動物及試劑購買
首先需要考慮:實驗動物品種、體重、性別、周齡(通常根據既往文獻報道可以獲得**)、數量(需要考慮到實驗有一定動物死亡率或者動物本身會打架互毆,因此需要提前購買足夠的動物)。
動物購買的途徑、安置的地點,飲食管理(一般實驗室會有動物房,也可以從其他地方購買),動物免疫證明、倫理證明需要提前準備好。
實驗相關的試劑和藥物:
比如造模藥物和器械,動物干預所需藥物,陽***物選擇及購買(有些藥物購買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創操作,要提前準備好**物(***建議提前購買),手術器械。
由于大部分研究使用到的是人類來源的細胞,種植到免疫正常的動物體內會發生免疫排斥反應。
一種是用beta巰基乙醇打開蛋白質分子二硫鍵的,另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的,但特點不一樣,前者更容易與氧氣反應,穩定性比后者差,如果在常溫下暴露在空中,前者只能維持24小時的活性,后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少,跑幾次就可以用完的樣品,這時選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多,計劃跑上幾十次的,優先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準備首先強調一下,一塊好的膠是跑好蛋白的前提,所以這個環節也不容忽視。玻璃板的選擇,一種是1毫米厚度的,另一種是,這個厚度選擇也是有講究的,如果上樣體積小于10微升,優先選1毫米,否則選。原因是什么?**在轉膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈,晾干。裝板,注意厚板和薄板的底部要對齊,否則會漏膠。加制膠的各成分前,要觀察液體是否有沉淀,有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說明依次加入各組分,加完SDS后先簡單手動搖勻幾下,然后迅速加入過硫酸銨和TEMED,搖勻,緊接著就灌膠。然后我習慣用95%的酒精壓膠,我也用過純水,感覺純水壓沒那么好,由于水的密度較大,會把分界處的膠壓得膨大。干貨分享 | PCR反應污染原因追蹤及污染處理方法。上海哪里有科研技術服務培養
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準備碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分鐘,然后轉移至轉膜液中平衡3分鐘后備用。2、轉膜組裝轉膜三明治夾,這一步很關鍵,重要的是膠和膜之間不能有氣泡且膜與膠要保證貼合緊密(否則會翻車),可以加多點轉膜液泡著。組裝好后加滿轉膜液,設置電源參數,我習慣恒流轉膜,200-280毫安,1-2小時,根據分子量定,如50KD的分子用60分鐘就夠了。如果一個電源帶兩個轉膜大槽即四塊膠,我就會用恒壓70-110V。這個過程重要的是做好降溫。這里簡單說一下蛋白分子量與玻璃板厚度,分離膠的濃度,轉膜電源參數的選擇問題。如果是能用1毫米的玻璃板就不用,因為轉膜是在電場的作用下蛋白分子從膠上遷移到膜上,1毫米膠的蛋白遷移距離要比。選擇更薄的膠蛋白轉膜時間可以減少,從而減少發熱,以免膠變形,條帶也會更好看。然后是分離膠的濃度,如果是150—200KD的分子選10%以下的的分離膠,200—300KD的選8%的,300KD以上的選6%的,小于30KD的200mA30分鐘,30-100KD的按分子量的數值算,如70KD,250mA70分鐘;100-150KD的250mA100分鐘;150—300KD的分子轉膜條件用280毫安(以上均是對于,),120分鐘足矣,前提是膠的濃度相適應。五、封閉孵一抗1、封閉轉膜結束后。上海裸鼠科研技術服務培養